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              蛋白互作網絡分析

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              項目介紹

                   在蛋白互作網絡中,連通性高的區域(模塊)可能經常代表著蛋白復合物或某些功能通路的組成部分,這些模塊可用于預測實驗關鍵調節生物過程或核心蛋白簇。

              分析方法

                    通過與STRING蛋白網絡互作數據庫比對后,提取confidence score > 0.7(high confidence)的蛋白集合互作關系,用Cytoscape軟件對蛋白互作網絡進行可視化。然后使用MCODE插件挖掘網絡中具有高連通性的模塊,進而對模塊中的蛋白進行功能富集分析,標記出每個模塊可能參與的關鍵生物過程。

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