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                蛋白質磷酸化修飾(Phosphorylation)

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                蛋白質磷酸化修飾(Phosphorylation)

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                項目介紹

                     蛋白質磷酸化修飾(Phosphorylation)是生物體內最重要的共價修飾方式之一,是目前分布最多、也是最廣泛研究的修飾,其發生過程是在激酶(kinase)催化下,將ATP的磷酸根基團轉移到蛋白的氨基酸(Ser、Tyr、Thr)側鏈上。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節著包括細胞增殖、發育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮及腫瘤發生等過程在內的所有生命活動。發生磷酸化修飾的氨基酸上共價連接磷酸基團,其分子質量會增加發生79.97Da。利用質譜可測定分子量是否發生79.97Da的質量偏移,從而檢測磷酸化修飾肽段及位點。 4D-label free磷酸化蛋白質組學是基于timsTOF Pro質譜儀,通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行差異磷酸化蛋白質組學分析。4D-label free修飾組,利用了離子淌度分離,能根據分子的形狀、截面積屬性,可有效區分修飾同分異構多肽,極大提高修飾的鑒定深度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

                技術路線

                技術優勢

                1. 4D技術加持,提高定量的準確性、鑒定深度,更加適合微量樣本;

                2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制,靈活方便;

                3. 基于質譜平臺(Bruker timsTOF pro),檢測速度提升近一倍;

                4. 經驗豐富——超17年蛋白平臺服務經驗,擁有豐富的高水平項目文章;

                5. 數據保證——采用進口金標抗體,數據結果穩定可靠;

                6. 系統解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯合分析,實現快捷”一站式”服務。

                數據分析

                1、標準數據分析內容

                鑒定分析:鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

                表達差異分析:差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

                多組的比較分析(組別>=3):mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

                功能分析:亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

                質量控制分析:肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

                2、高級數據分析

                功能分析:GSEA富集分析。

                臨床藥物研究:藥物靶點注釋。

                標志物篩選:集成機器學習。

                與臨床表征的聯合分析:熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

                推薦組合產品

                1. 蛋白質組+磷酸化組:全面剖析機體調控網絡。

                2. 磷酸化組+代謝組:打通機體表型-機制研究通路。

                推薦應用領域

                1. 神經及退行性疾病;

                2. 腫瘤發病機制研究;

                3. 藥理藥靶研究。


                樣品要求

                項目案例

                蛋白質磷酸化修飾(Phosphorylation)

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