預(yù)存
                
                

                                
                
                            
                
        
                
        
                
            
                
                
            
                


            
                
                
                
                    
                
                        
                    
                
                
                
            
                

        
                
    
                











                
    
                
        
                
        
                
            
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    Document
    





    
                
        
                
            
                
                
                當前位置：生物測試 ?  測序平臺 ? 
                
                
                轉(zhuǎn)錄組
                
            
                
            
                
                
                
                    
                
                        
                
                            
                99%
                滿意度
                
                            
                

                                                            
                
                                    
                                
                


                            
                
                                
                轉(zhuǎn)錄組
                
                                
                                
                
                                    
                已 預(yù) 約：
                
                                    
                2510次
                
                                
                
                                
                
                                    
                服務(wù)周期：
                
                                    
                平均25個工作日完成
                
                                
                
                                                                

                                                                
                
                                                                                                                        
                
                                                立即下單
                                            
                                                                                            
                咨詢價格
                                        
                                                    
                
                                        
                                            
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                如有各類設(shè)備采購需求，請聯(lián)系專屬顧問。
                
                            
                
                        
                

                        
                        
                        
                        
                        
                        
                        
                    
                

                    
                    
                    
                    

                    
                
                        
                項目介紹
                
                        
                通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究以揭示生物學(xué)現(xiàn)象或疾病發(fā)生的分子機制是高通量組學(xué)研究的一個常用策略。利用高通量測序技術(shù)在全面快速得到基因表達譜的同時，還可以通過測定的序列信息精確地分析轉(zhuǎn)錄本的SNP、可變剪接等序列及結(jié)構(gòu)變異。
                技術(shù)特點
                1.除了計算基因的表達水平，更可以檢測轉(zhuǎn)錄本的序列和構(gòu)變異。
                2.測序深度的增加可以獲得更廣的動態(tài)檢測范圍，能夠同時鑒定和定量高豐度轉(zhuǎn)錄本和低豐度轉(zhuǎn)錄本，信號強度的跨度可達6個數(shù)量級。
                3. 除了檢測已知轉(zhuǎn)錄本的表達水平外，還能夠發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本。
                4. 在應(yīng)用于尚無參考基因組的物種時，可以通過從頭組裝發(fā)現(xiàn)新基因。
                實驗流程
                圖中深色為該實驗流程
                分析流程
                標準分析
                （1） 數(shù)據(jù)過濾及比對分析
                （2） 轉(zhuǎn)錄本拼接
                高級分析
                （3） 差異表達基因篩選
                （4） 差異表達基因聚類分析
                （5） 使用GO/KEGG分析，推測突變基因富集在哪些代謝通路。

                
                    
                
                    
                
                        
                樣品要求
                
                        
                樣本要求
                RNA濃度≥20ng/ul ，總量≥2ug    
                細胞數(shù)≥5X106
                
                    
                
                    
                
                            
                項目案例
                
                            
                

























                                                                    
                
                                            
                                            
                
                                        
                
                                            
                                            
                
                                        
                
                                            
                                            
                
                                        
                
                                            
                                            
                
                                        
                
                            
                
                        
                                    
                
                            
                常見問題
                
                            
                
                                
                
                                        
                1、真核轉(zhuǎn)錄組常規(guī)建庫流程
                
                                        
                1）通過磁珠和mRNA的polyA結(jié)構(gòu)將mRNA分離出來；
                2）mRNA片段化；
                3）mRNA反轉(zhuǎn)錄為雙鏈結(jié)構(gòu)，第二鏈cDNA合成時，其中的堿基T，被替換成U，從而達到鏈特異性文庫的目的；
                4）5’末端修復(fù)、3’末端加A；
                5）加接頭；
                6）選擇特異長度回收，一般為300bp；
                7）PCR；
                8）上機測序。
                
                                    
                
                                        
                2、原核轉(zhuǎn)錄組測序用到哪些試劑？
                
                                        
                1）RNA提取：Trizol Reagent；
                2）核糖體RNA去除：IlluminaRibo-Zero? Magnetic Kit；
                3）文庫構(gòu)建：IlluminaTruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep Kit；
                4）上機測序IlluminaNextSeq?500 High Output Kit v2。
                
                                    
                
                                        
                3、什么是小RNA測序？
                
                                        
                Small RNA測序，研究某一物種特定組織在特定狀態(tài)下的已知SmallRNA，也可發(fā)現(xiàn)新的或該物種的Small RNA并預(yù)測其靶基因，為研究Small RNA的功能及此物種的基因調(diào)控機制提供了有力工具。Small RNA主要包括微RNA（miRNA）、小干擾RNA（siRNA）、與piwi相互作用的RNA（piRNA）三類。
                
                                    
                
                                        
                4、哪些物種可以研究lncRNA？
                
                                        
                要做lncRNA分析，對物種有以下要求：
                a. 物種為真核生物；
                b. 物種具有參考基因組；
                c. 具有較為完整的注釋。
                
                                    
                
                                        
                5、為什么CircRNA測序的研究比較熱？
                
                                        
                1）多角度闡述分子生物學(xué)問題的需要；
                2）從新的角度發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致樣本存在差異的需要；
                3）尋找影響疾病發(fā)生的分子標記；
                4）探究circRNA的未知功能；
                5）尋找導(dǎo)致microRNA表達發(fā)生變化的機理。
                
                                    
                
                                        
                6、全轉(zhuǎn)錄組測序是怎么做的？
                
                                        
                全轉(zhuǎn)錄組測序是將樣品分為兩份，構(gòu)建2個文庫，1個小RNA文庫（包含miRNA）和一個去除核糖體的鏈特異性文庫（包含mRNA，lncRNA，和circRNA），然后分別上機測序，最后主要獲得4類RNA——miRNA，lncRNA，mRNA，circRNA的序列信息。
                
                                    
                                            
                
                        
                                                    
                
                
            
                
        
                
        
        
                
            
                
                
                
                    
                轉(zhuǎn)錄組
                
                                                                        
                
                                立即下單
                            
                                
                
            
                
        
                
    
                










    
    
    
    
    



    


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