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                Document

                當前位置:生物測試 ?  測序平臺 ? 

                基因組

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                基因組

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                如有各類設備采購需求,請聯(lián)系專屬顧問。
                項目介紹

                基因組學:基因組學是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學學科。基因組學主要研究基因組的結構、功能、進化、定位和編輯等,以及它們對生物體的影響。

                動植物基因組

                動植物基因組de novo測序、遺傳變異檢測、BSA性狀定位、遺傳圖譜構建、群體進化、全基因組關聯(lián)分析、SSR分子標記開發(fā)

                人基因組

                全外顯子組測序、人基因組重測序、目標區(qū)域捕獲測序

                微生物基因組測序

                細菌基因組de novo測序、細菌基因組重測序、真菌基因組de novo測序、真菌基因組重測序、病毒基因組測序、線粒體&葉綠體基因組測序、質(zhì)粒&BAC克隆子基因組測序

                樣品要求

                1. 送樣需標清樣品編號,封口處用封口膜密封;

                2. 送樣前請與技術人員溝通送樣條件,樣品保存期間切勿反復凍融。

                樣本類型送樣要求
                動植物基因組樣本
                植物組織嫩葉鮮重2g
                高等或大型動物肌肉組織鮮重2g
                微體型動物動物體累計鮮重2g
                昆蟲正常體型3g,微體型2g
                血液(抗凝)正常體型3g,微體型2g
                微生物基因組樣本(建議送樣量3倍以上)
                細菌框架圖菌體0.1g/核酸0.2μg
                細菌完成圖pacbio(革蘭氏陰性菌)菌體0.5g/核酸5μg
                細菌完成圖pacbio(革蘭氏陽性菌)菌體0.7g/核酸5μg
                細菌完成圖nanopore菌體0.5g/核酸3μg
                人基因組樣本
                基因組DNA濃度≥20ng/μl,總量≥2μg
                血液(抗凝)新鮮血液2-3ml,-20℃保存


                項目案例
                常見問題
                1、基因組框架圖和精細圖有什么不同?

                框架圖能覆蓋基因組常染色體區(qū)域90%,覆蓋基因區(qū)域95%,Contig N5到5 kb,Scaffold N50達到20 kb,單堿基錯誤率在十萬分之一以下。精細圖能覆蓋基因組常染色體區(qū)域95%,覆蓋基因區(qū)域98%,Contig N5到20 kb,Scaffold N50達到300 kb,單堿基錯誤率在十萬分之一以下。

                2、動植物基因組從頭測序時為什么需要構建不同類型的文庫?

                因為動植物基因組大、復雜度高,且存在大量的重復區(qū)域,因此需要制備不同梯度的測序文庫,進行雙末端測序,使得在拼接中能夠跳過大范圍的重復區(qū),從而避免了基因組中重復序列造成 的錯拼,提高了拼接的質(zhì)量;同時結合BAC或Fosmid文庫以及多種測序平臺的綜合運用,保證了測序的準確性和基因組的完整性,從而完成高等動植物的基因組圖譜繪制。

                3、外顯子組測序需要多少的覆蓋深度?

                測序深度根據(jù)研究目的、樣本量及客戶的預期而定,建議有效測序深度100×以上,單基因遺傳病推薦至少100×,腫瘤等體細胞突變疾病推薦200×以上。

                4、人全基因組測序的優(yōu)勢是什么?

                人全基因組測序可以挖掘各種遺傳變異,一些大的結構變異,與全外顯子測序相比,不局限于編碼區(qū)變異,可以在全基因組范圍內(nèi)尋找與疾病或功能相關的位點。

                基因組

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