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              Document

              當(dāng)前位置:生物測試 ?  測序平臺 ? 

              基因組

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              基因組

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              如有各類設(shè)備采購需求,請聯(lián)系專屬顧問。
              項目介紹

              基因組學(xué):基因組學(xué)是對生物體所有基因進(jìn)行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學(xué)學(xué)科。基因組學(xué)主要研究基因組的結(jié)構(gòu)、功能、進(jìn)化、定位和編輯等,以及它們對生物體的影響。

              動植物基因組

              動植物基因組de novo測序、遺傳變異檢測、BSA性狀定位、遺傳圖譜構(gòu)建、群體進(jìn)化、全基因組關(guān)聯(lián)分析、SSR分子標(biāo)記開發(fā)

              人基因組

              全外顯子組測序、人基因組重測序、目標(biāo)區(qū)域捕獲測序

              微生物基因組測序

              細(xì)菌基因組de novo測序、細(xì)菌基因組重測序、真菌基因組de novo測序、真菌基因組重測序、病毒基因組測序、線粒體&葉綠體基因組測序、質(zhì)粒&BAC克隆子基因組測序

              樣品要求

              1. 送樣需標(biāo)清樣品編號,封口處用封口膜密封;

              2. 送樣前請與技術(shù)人員溝通送樣條件,樣品保存期間切勿反復(fù)凍融。

              樣本類型送樣要求
              動植物基因組樣本
              植物組織嫩葉鮮重2g
              高等或大型動物肌肉組織鮮重2g
              微體型動物動物體累計鮮重2g
              昆蟲正常體型3g,微體型2g
              血液(抗凝)正常體型3g,微體型2g
              微生物基因組樣本(建議送樣量3倍以上)
              細(xì)菌框架圖菌體0.1g/核酸0.2μg
              細(xì)菌完成圖pacbio(革蘭氏陰性菌)菌體0.5g/核酸5μg
              細(xì)菌完成圖pacbio(革蘭氏陽性菌)菌體0.7g/核酸5μg
              細(xì)菌完成圖nanopore菌體0.5g/核酸3μg
              人基因組樣本
              基因組DNA濃度≥20ng/μl,總量≥2μg
              血液(抗凝)新鮮血液2-3ml,-20℃保存


              項目案例
              常見問題
              1、基因組框架圖和精細(xì)圖有什么不同?

              框架圖能覆蓋基因組常染色體區(qū)域90%,覆蓋基因區(qū)域95%,Contig N5到5 kb,Scaffold N50達(dá)到20 kb,單堿基錯誤率在十萬分之一以下。精細(xì)圖能覆蓋基因組常染色體區(qū)域95%,覆蓋基因區(qū)域98%,Contig N5到20 kb,Scaffold N50達(dá)到300 kb,單堿基錯誤率在十萬分之一以下。

              2、動植物基因組從頭測序時為什么需要構(gòu)建不同類型的文庫?

              因為動植物基因組大、復(fù)雜度高,且存在大量的重復(fù)區(qū)域,因此需要制備不同梯度的測序文庫,進(jìn)行雙末端測序,使得在拼接中能夠跳過大范圍的重復(fù)區(qū),從而避免了基因組中重復(fù)序列造成 的錯拼,提高了拼接的質(zhì)量;同時結(jié)合BAC或Fosmid文庫以及多種測序平臺的綜合運用,保證了測序的準(zhǔn)確性和基因組的完整性,從而完成高等動植物的基因組圖譜繪制。

              3、外顯子組測序需要多少的覆蓋深度?

              測序深度根據(jù)研究目的、樣本量及客戶的預(yù)期而定,建議有效測序深度100×以上,單基因遺傳病推薦至少100×,腫瘤等體細(xì)胞突變疾病推薦200×以上。

              4、人全基因組測序的優(yōu)勢是什么?

              人全基因組測序可以挖掘各種遺傳變異,一些大的結(jié)構(gòu)變異,與全外顯子測序相比,不局限于編碼區(qū)變異,可以在全基因組范圍內(nèi)尋找與疾病或功能相關(guān)的位點。

              基因組

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