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              生物標(biāo)志物預(yù)測分析

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              生物標(biāo)志物預(yù)測分析

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              項(xiàng)目介紹

                   癌癥相關(guān)的生物標(biāo)志物是表明腫瘤狀態(tài)、進(jìn)展特征和對相關(guān)治療產(chǎn)生反應(yīng)的生物功能分子(基因、蛋白質(zhì)或小分子物質(zhì))。已發(fā)現(xiàn)的癌癥相關(guān)生物標(biāo)志物大多是轉(zhuǎn)錄因子,細(xì)胞表面受體或其他組織細(xì)胞響應(yīng)癌癥細(xì)胞而產(chǎn)生的分泌蛋白。針對蛋白質(zhì)組學(xué)中的大規(guī)模質(zhì)譜樣本或臨床樣本,獲取在不同樣本類別間(二類別或者多類別)表達(dá)量具有顯著差異的一組蛋白或基因,作為篩選得到的潛在候選生物標(biāo)志物。適用范圍:

              1、二分類或多類別樣本,每個(gè)類別內(nèi)的樣本不少于 40 個(gè)。

              2、對于二分類樣本,要求數(shù)量較多樣本與數(shù)量較少樣本的數(shù)量比例應(yīng)小于 2:1;對于多類別樣本,要求數(shù)量最多樣本與數(shù)量最少樣本的數(shù)量比例應(yīng)小于 2:1。

              分析方法

                    本分析流程主要基于 Scikit-learn 機(jī)器學(xué)習(xí)函數(shù)庫,包括特征排序、模型構(gòu)建、模型評估和結(jié)果可視化展示等分析模塊??梢曰谝延薪Y(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)得到全局最優(yōu)模型、局部最優(yōu)模型、候選生物標(biāo)志物及可視化結(jié)果。

              樣品要求

              詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

              項(xiàng)目案例

              篩選得到特征蛋白打分柱狀圖

              篩選得到特征蛋白打分柱狀圖

              全局最優(yōu)模型在訓(xùn)練集和測試集上的ROC曲線

              高排序蛋白在不同類別樣本中的表達(dá)量箱型圖

              學(xué)術(shù)文章

              生物標(biāo)志物預(yù)測分析

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