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              蛋白質(zhì)功能富集分析

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              蛋白質(zhì)功能富集分析

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              項目介紹

                   高通量蛋白質(zhì)組學(xué)分析往往會得到大量差異表達(dá)蛋白,簡單的統(tǒng)計很難將這些差異蛋白與某個待研究的生物學(xué)現(xiàn)象及其潛在機(jī)制聯(lián)系起來。功能富集分析可以幫助我們快速從龐雜的組學(xué)數(shù)據(jù)中發(fā)掘規(guī)律,期望發(fā)現(xiàn)在生物學(xué)過程中起關(guān)鍵作用的生物通路,從而揭示和理解生物學(xué)過程的基本分子機(jī)制。

              方法

                    富集分析采用 Fisher 精確檢驗方法檢測待測功能集在差異蛋白中是否顯著富集。這些功能集可以是 Gene Ontology 功能、KEGG 通路、蛋白結(jié)構(gòu)域、Complex(復(fù)合體)等。富集分析結(jié)果通常用富集程度(fold enrichment),富集顯著性(p value)兩個特征來描述差異蛋白在指定功能集中的富集情況,當(dāng) p value < 0.05 時認(rèn)為富集是具有統(tǒng)計學(xué)意義的

              樣品要求

              詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

              項目案例

              顯著富集 GO 功能氣泡圖

              GO 功能有向無環(huán)網(wǎng)絡(luò)圖

              學(xué)術(shù)文章

              蛋白質(zhì)功能富集分析

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