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              蛋白組+修飾組關(guān)聯(lián)分析

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              項目介紹

                   在生物體內(nèi)各種翻譯后修飾過程不是孤立存在的,當某個關(guān)鍵蛋白發(fā)生修飾后,會影響與其直接相互作用的蛋白或?qū)е峦飞舷掠蔚鞍装l(fā)生變化。蛋白互作網(wǎng)絡是用于分析這一復雜生物過程的有效手段。

              分析方法

                    修飾組學與蛋白組學鑒定到的蛋白通過與STRING蛋白網(wǎng)絡互作數(shù)據(jù)庫比對后,提取confidence score > 0.7(high confidence)的蛋白集合互作關(guān)系,用Cytoscape軟件對蛋白互作網(wǎng)絡進行可視化。然后使用MCODE插件挖掘網(wǎng)絡中具有高連通性的模塊,進而對模塊中的蛋白進行功能富集分析,標記出每個模塊可能參與的關(guān)鍵生物過程。

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