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                當(dāng)前位置:生物測試 ?  測序平臺 ? 

                SmallRNA

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                SmallRNA

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                項目介紹

                Small RNA是一大類調(diào)控分子,幾乎存在于所有的生物體中。Small RNA包括:microRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。Small RNA通過多種多樣的作用途徑,包括mRNA降解、翻譯抑制、異染色質(zhì)形成以及DNA去除,來調(diào)控生物體的生長發(fā)育和疾病發(fā)生。Small RNA轉(zhuǎn)錄組測序是鑒定和定量解析small RNA的新方法和有力工具。

                技術(shù)特點

                1.可以直接從核苷酸水平上研究Small RNA分子,不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題,非常利于區(qū)分相同家族以及序列極為相似的不同Small RNA分子;

                2.可以對任意物種進行高通量分析,無需任何預(yù)先的序列信息以及二級結(jié)構(gòu)信息。

                3.靈敏度高,測序通量大,為Small RNA分子的發(fā)現(xiàn)和研究提供了極大的數(shù)據(jù)深度與覆蓋率,能夠檢測豐度極低的稀有轉(zhuǎn)錄;

                      4.測序產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)可以與多種分析軟件兼容,可以注釋Small RNA的基因組信息,并分析其表達水平,能夠隨時使用公用Small RNA數(shù)據(jù)庫注釋已知的Small RNA,還可以進一步分析  未匹配的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)新的Small RNA種類及異構(gòu)體,尋找更深入的研究信息。

                實驗流程

                圖中深色為該實驗流程

                分析流程

                標準分析

                (1) 數(shù)據(jù)過濾及比對

                (2) MicroRNA的比對分析及預(yù)測

                高級分析

                (3) MicroRNA表達水平分析

                (4)MicroRNA表達差異性分析


                樣品要求

                送樣要求

                RNA濃度≥200ng/ul,總量≥2ug

                細胞數(shù)≥5ⅹ106

                項目案例

                對68個標本的聚類分析

                亞型差異表達維恩圖分析

                差異表達基因熱圖分析

                SmallRNA

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