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              當(dāng)前位置:生物測(cè)試 ?  代謝組學(xué)平臺(tái) ? 

              高分辨空間代謝組

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              高分辨空間代謝組

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              項(xiàng)目介紹

              MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing )采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù),通過5'-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段并進(jìn)行高通量測(cè)序。研究者通過MeDIP Sequencing可以快速有效地尋找基因組上的甲基化區(qū)域,從而比較不同樣本間DNA甲基化修飾模式的差異。此方法可以覆蓋整個(gè)基因組范圍的甲基化區(qū)域并且成本較低,特別適用于多樣品的全基因組DNA表觀遺傳研究。

              技術(shù)特點(diǎn)

              1、檢測(cè)疾病樣本中DNA甲基化信號(hào)富集區(qū)域并推斷樣本中表達(dá)被 抑制的候選基因集合。

              2、檢測(cè)疾病發(fā)生發(fā)展不同時(shí)期,病灶部位的DNA甲基化動(dòng)態(tài)圖譜,篩選表觀遺傳標(biāo)志幫助界定疾病發(fā)展程度。

              3、比較疾病樣本和正常樣本中DNA甲基化區(qū)域的信號(hào)和位置分布的差異,篩選疾病特異性DNA甲基化區(qū)域,觀察這些區(qū)域周圍的基因,縮小疾病相關(guān)候選基因范圍。

              實(shí)驗(yàn)流程

              分析流程

              標(biāo)準(zhǔn)分析

              (1) 數(shù)據(jù)過濾及比對(duì)

              (2) MeDIP分布趨勢(shì)分析

              高級(jí)分析

              (3) MeDIP富集peak信息

              (4) 基于peak的多樣品間差異分析

              樣品要求

              樣本要求:

              DNA濃度≥10ng/ul ,總量≥2ug    

              細(xì)胞數(shù)≥1ⅹ107

              項(xiàng)目案例

              學(xué)術(shù)文章

              高分辨空間代謝組

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